Общий контингент обучаемых составляет более 88 тысяч человек, в том числе по программам высшего образования (ВО) – около 28 тысяч человек; по программам среднего профессионального образования (СПО) – более 5 тысяч человек.
В составе университета 3 академии (Российская академия путей сообщения, Российская открытая академия транспорта, Академия водного транспорта, АВТ)
7 институтов (Гуманитарный институт; Институт международных транспортных коммуникаций; Институт пути, строительства и сооружений; Институт транспортной техники и систем управления; Институт управления и информационных технологий; Институт экономики и финансов; Юридический институт),
Научно-исследовательский институт транспорта и транспортного строительства,
Научно-исследовательский технологический институт, НИТИ,
Отраслевой центр подготовки научно-педагогических кадров высшей квалификации,
Вечерний факультет, Центр "Предуниверсарий", Центр «Высшая школа педагогического мастерства», Центр подготовки научных сотрудников, ЦПНС, Лингвистический центр, ЛЦ
Гимназия,
4 колледжа (Правовой колледж, Медицинский колледж, Московский колледж транспорта, МКТ, Колледж академии водного транспорта, Колледж АВТ)
Ведущий национальный транспортный вуз - Российский университет транспорта является передовым межтранспортным и общетранспортным научно-образовательным центром. Его называют крупнейшим отраслевым университетом России, базовым центром кадрового обеспечения и научного сопровождения развития транспортной отрасли.